Starania o budowę kościoła rozpoczęły się wraz z powołaniem w 1977 roku ośrodka duszpasterskiego w Prokocimiu Nowym. Dwa lata później (1979) zapadła decyzja lokalizacyjna, a 5 lipca 1982 uzyskano pozwolenie na realizację pierwszego etapu budowy - budynku katechetycznego. Budowa kościoła rozpoczęła się w 1987 roku, fundamenty zakończono wykonywać w roku 1989.
Od 1990 roku wznoszono ściany kościoła, a w 1993 roku rozpoczęto betonowanie stropu. Od 2 do 11 listopada 1993 trwało betonowanie konstrukcji krzyża z wykorzystaniem specjalnie sprowadzonego, 20-metrowego wysięgnika. W 1994 zabetonowano ćwiartki stropu, a w 1995 wieżę.